Las fórmulas hipoalergénicas se obtienen por un fraccionamiento parcial de las proteínas, mientras que en los hidrolizados el fraccionamiento es completo, por lo que éstos se recomiendan como alimentación sustitutiva de elección en los niños alérgicos a proteínas de leche de vaca. Las denominadas fórmulas hipoalergénicas no deben emplearse en estos casos.